自律システムまたは、自律系(Autonomous_system)とは、システム（系）が何を表すかよっていくつかの意味がある。
インターネットにおける自律システムとはひとつの（時に複数）のルーティングポリシー配下にあるIPネットワークやルータの集合のことを言う。詳細は自律システム (インターネット)を参照のこと。
数学の世界における自律系と呼ばれる微分方程式の系（システム）は、自励系を参照。
システム工学における自律システムとは、自ら判断したり調整したりするシステムのことである。ロボットやプログラムなどで使われる。詳細は自律システム (システム工学)を参照のこと。